Здравствуйте, Илья!

1) При выплате Вам действительной стоимости доли ОДО как налоговый агент удержало из выплачиваемой Вам суммы подоходный налог и перечислило его в гос. бюджет. Этого достаточно, подавать налоговую декларацию по этому поводу и уплачивать что-либо дополнительно Вам самому не нужно.

2) Если покупателем было физическое лицо, то Ваша супруга, получившая в 2017 году доход от продажи доли в ОДО, должна до 01 марта 2018 г. подать в ИМНС декларацию по подоходному налогу и уплатить налог не позднее 15 мая 2018 г. Если в 2018 и в последующих годах она получит еще какие-либо платежи от продажи доли — то схема та же: до 01 марта следующего за отчетным года подается декларация и до 15 мая уплачивается подоходный налог. Если же покупателем было юридическое лицо, то оно как налоговый агент должно само удержать и перечислить в бюджет подоходный налог с выплачиваемых физлицу сумм доходов.

Примечание: льгота по подоходному налогу от продажи доли, установленная подп. 1.24-1 ст. 163 НК, на Ваши случаи не распространяется, так как согласно ч. 2  подп. 1.24-1 ст. 163 НК, «положения части первой настоящего подпункта применяются в отношении долей в уставном фонде, приобретенных плательщиком начиная с 1 января 2014 года».  А у Вас доля была приобретена раньше, чем 01.01.2014 г.