Здравствуйте, Александр!

Взаимоотношения директора и предприятия подчинены трудовому законодательству, а в соответствии с требованиями трудового законодательства работнику (пусть даже он одновременно является учредителем) должна выплачиваться заработная плата. Невыплата является нарушением.

Если бы предприятие вообще не осуществляло деятельность, то директора можно было бы отправить в отпуск без сохранения заработной платы. А если осуществляет — значит, директор работает и ему предприятие должно выплачивать зарплату.

Но Вы можете в целях экономии оформить директору неполную ставку (напр., 0,25).